本機關成立於民國三十九年原隸屬建設局，嗣於民國五十六年奉令隸屬警察局受其指揮監督直至民國六十八年七月一日本市改為院轄市，奉行政院核定改隸屬工務局。 後又於民國九十一年七月二十二日奉高雄市議會第五屆第十二次臨時會第六次會議通組織修編案， 修改機關名稱為：高雄市政府工務局違章建築處理大隊。置大隊長一人、副大隊長一人、下設三組，預算員額為：員三十人、工九十人、合計一二０人。
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